Hội đồng Khoa Khoa học biển và Hải đảo được thành lập theo quyết định số 1737/QĐ-TĐHHN về việc Công nhận Hội đồng Khoa, Chủ tịch và Thư ký Hội đồng Khoa của các Khoa, Bộ môn trực thuộc Trường Đại học Tài nguyên và Môi trường Hà Nội.
Căn cứ Quyết định số 70/2014/QĐ-TTg, ngày 10 tháng 12 năm 2014 của Thủ tướng Chính phủ ban hành Điều lệ trường đại học; Căn cứ Quyết định số 456/QĐ-BTNMT, ngày 08 tháng 02 năm 2018 của Bộ trưởng Bộ Tài nguyên và Môi trường về việc Quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Trường Đại học Tài nguyên và Môi trường Hà Nội; Xét đề nghị của Trưởng khoa Khoa học biển và hải đảo, Trưởng phòng Tổ chức – Hành chính,
Bộ môn Khoa học biển được thành lập theo Quyết định số 330/QĐ-TĐHHN ngày 27/02/2013 về việc thành lập bộ môn Khoa học biển của Hiệu trưởng Trường Đại học Tài nguyên và Môi trường Hà Nội. Theo quyết định của Bộ Tài nguyên và Môi trường ngày 24/6 về chức năng nhiệm vụ của trường đại học Tài nguyên và Môi trường Hà Nội, Bộ môn Khoa học Biển chính thức được nâng cấp lên thành Khoa Khoa học Biển và Hải đảo.